總統在最新一期「阿扁總統電子報」，回覆讀者來信時對中共提出上述呼籲。
他說，中共一九九九年藉口法輪功爲「邪教」組織，展開鎮壓行動，導致成千上萬法輪功學員遭受逮捕拘禁。在「宗教信仰自由」普世價值下，中共對法輪功的打壓，只會讓人對共產政權專制暴政，更加深惡痛絕。
總統表示，相較於臺灣，在憲法保障宗教信仰自由條文下，法輪功在臺灣相當活躍，隨處可見法輪大法的教學，政府也從未乾預過。這就是民主自由、專制極權最大不同處。
近來媒體披露中共對拘禁中的法輪功學員，以活體摘除器官方式，作人體器官移植手術，賺取黑心暴利，再火化毀屍滅跡，行徑令人髮指，引起國際社會關切。
陳總統表示，中共在此事件遭披露後，沉默了三個星期，才由外交部出面否認，並表示歡迎國際社會組團前往調查。
他說，雖然目前尚未有直接證據得以證明，但相關人士指述歷歷、中共境內器官移植手術案例明顯較他國偏高、強制對獄中的法輪功學員抽血檢驗行爲、早些年曾引起世界軒然大波的中共監獄出售死刑、重刑犯的器官事件，在在都予人其真實的可能性。
因此，總統呼籲，深切盼望面對相關人士具體指控，中共不應只是一味否認、掩飾，而要主動、深入調查，將涉案人員繩之以法。
他也呼籲，中共也應該檢討惡劣人權紀錄，並積極推動政治改革，將權力完整的還給人民，如此才能有效杜絕政濫權及對人權的侵害。