内蒙古引起中央关注的案件，最令人关注的包括内蒙古首府呼和浩特动用3.2亿元盖起的豪华党政办公大楼，以及16名司法人员因违法犯罪被追究刑事责任的事件。在两件事件中，争议最大的都是内蒙古自治区政府处理事件的手法。
中国中央电视台较早前揭发，2000年动工，2001年交付使用的呼和浩特市政府办公大楼，竟然发现这么一座投资3亿多元的政府大楼至今欠款2913万元，其中不少是民工血汗钱。一位副市长面对央视记者说，自己说不准还账的具体时间，“只能说尽快尽快”。
值得注意的是，份属“团派”官方刊物的《中国青年报》，在1月19日刊登了一篇题为《如此特大腐败之举，内蒙古媒体为何集体失语？》的文章，矛头直指内蒙古省委。该文说：“奇怪的是，这种明显违反中央有关规定，明显损害公众利益的事情，最了解内情的当地媒体集体失语，而由远在千里的南京媒体披露，令人不得其解。”
另外，2003年12月13日，原内蒙古包头市公安局公共交通治安分局刑警三中队队长李建华，因犯有受贿，非法拘禁，徇私枉法三项罪名成立，被判处有综合刑期18年，决定执行刑期17年。在此之前，内蒙古已经有15名司法人员因违法犯罪被追究刑事责任，李建华是内蒙古2003年以来的第16名。
值得留意的是，这个案件背后可能另有内情。当天新华社旗下的新华网就发文指出：“这样一个有污点的警察，参加学习班的时候是个副队长，从学习班出来不仅没降职，反而被晋升为中队长。是谁在为李建华撑腰？”
内蒙古的司法系统似乎问题不少：在去年，内蒙古各级检察机关还针对各级法院审判活动中的违法问题，提出纠正意见25件（次），对违法办理减刑、假释、暂予监外执行的，依法纠正129件。此外，还受理群众反映公安机关有案不立、有罪不究的线索445件，促成公安机关直接立案232件，接通知立案69件。
正如去年某一期的广东《南风窗》引述一位不愿具名的北京大学学者指出：在中国“领导个人权力过大，权力没有规范和界限”。他指出，中国的省委书记有权解除一个普通公务员的职务，有权拒绝一个普通司法官要求他作证和对他的调查，有权指使员警把一个公民关押起来或要求法院治人之罪。放诸内蒙古的例子，内蒙古自治区书记储波实在是很难逃脱有关的政治责任。
在中国官场，储波被广泛视为江泽民系人马。在九十年代，湖南在经济发展战略上有一个争论，一派认为湖南应该“南向（广东）”，另一派认为湖南还是该“北向（上海）。在九十年代历任中共湖南省岳阳市委书记，中共湖南省委副书记，湖南省副省长、代省长至湖南省省长的储波，一直大力推动湖南“北向发展”，向上海靠拢。
后来，出身石油系统，今年10月满60岁的储波，被保送往中央党校学习期间，更是和当时的组织部部长，也是出身石油系统的中国国家副主席曾庆红一见如故。他由曾庆红引荐认识了江泽民，江泽民对储波的高远眼光也是十分赏识，所以力保他升任内蒙古自治区书记。
值得注意的是，中央也刚刚宣布了，曾在1983到1985年期间出任共青团内蒙古自治区伊克昭盟盟委书记的杨晶，被任命为内蒙古自治区主席。一旦储波离职，杨晶会否取而代之，也是值得继续观察的亮点。