他18岁进剑桥大学学习，27岁即出任剑桥大学教授，发明微积分与积分法两项定理。他在天文、地理、数学、神学等方面都取得了辉煌成就。他发现了普通白光由七色组成，出版了近代科学奠基性巨著《自然科学的数学原理》。他发现了运动三定律和万有引力定律，为近代力学奠定基础，实现了以伽利略为先导的数学与实验手段的结合。牛顿虽然在科学上做出了无与伦比的贡献，但他总结了科学的发展规律后认为，人类理性的能力有限，不能包容一切经验，所以他开始相信圣经中的预言。1703年他被选为英国皇家学会会长，直到临终，连任长达25年。
牛顿年轻时，曾怀疑高级生命的存在，但自从他精密研究考察奇妙的宇宙构造后，便深深地感到创造宇宙者的伟大，实在无可测度。他虽然是举世闻名的大科学家，却自认为对宇宙的奥秘所知有限，几如沧海一粟。他曾说：“在没有物质的地方有什么存在呢？太阳与行星的引力从何而来呢？宇宙万物为什么井然有序呢？行星的作用是什么？动物的眼睛是根据光学原理设计的吗？岂不是宇宙间有一位造物主吗？虽然科学未能使我们立刻明白万物的起源，但这些都引导我们归向万有的神面前。”
论到天体的构造与运行，牛顿严正地表示：“从诸天文系的奇妙安排，我们不能不承认这必是全知全能的高级生命的作为。宇宙间一切有机无机的万象万物，都是从永生真神的智慧大能而来；他是充满万有，全知全能的；他在这无边无量、井然有序的大千世界中，凭其旨意，创造万物，运行万物，并将生命、气息、万物赐给人类；我们的生活，动作、存留，都在乎他。宇宙万物，必有一位全能的神在掌管统治。在望远镜的末端，我看到了神的踪迹。”他还说：“毫无疑问，我们所看到的这个世界，其中各种事物是绚丽多彩，各种运动是如此错综复杂，它不是出于别的，而只能出于指导和主宰万物的神的自由意志。”
牛顿毕生的主要精力用于对精神世界的探索，视科学为余事。他在谈到自己的科学成就时说，他不过是在“追随神的思想”，“照神的思想去思想而已”。牛顿有一位朋友，就是英国著名天文学家哈雷，他因推算出一颗彗星的轨道，这颗彗星后来被命名为哈雷彗星，他却不肯相信宇宙中一切的天体是神创造的。有一次，牛顿造了一个太阳系模型，中央是一个镀金的太阳，四围各大行星各照各的位置排列整齐，一拉曲柄，各星立即照自己的轨道和谐转动，非常形象和美妙。一天，哈雷来访，见到这模型，玩弄了好久，惊叹叫好，立刻问这是谁造的。牛顿回答说，这个模型没有人设计和制造的，只不过是偶然有各种材料凑巧碰在一起而形成的。哈雷说，无论如何必定有一人造它，并且是位天才的人。这是牛顿拍着哈雷的肩头说：“这个模型虽然精巧，但比起真正太阳系，实在算不得什么，你尚且相信一定有人制成它，难道比这个模型精巧亿万倍的太阳系，岂不是应该有全能的神，用高度智慧创造出来的？”哈雷才恍然大悟，也相信了有神存在。
牛顿临终前，面对仰慕他智慧和称颂他伟大科学成就的人，却谦虚地说：“我的工作和神的伟大创造相比，我只是一个在海边拾取小石和贝壳的小孩子。真理浩瀚如海洋，远非我们所能尽窥”。
安葬在英国伦敦威斯敏斯特大教堂的牛顿的墓碑上铭刻着：“艾萨克．牛顿爵士于此长眠。以自己发明的数学方法以及高度智慧，揭示行星的运动、彗星的轨道和海洋的潮汐；探究了任何人也没有预想的光的分解和色的本性；解释了自然和古代的事情。他以哲学证明了全能神的伟大，他一生过着朴素的生活。这位值得称夸的人物，岂不是全人类的光荣？”
牛顿不但是一位伟大的科学家， 而且是一位虔诚的宗教信徒， 研究宗教经典的浓厚兴趣决不在科学以下。他所发表的科学著作只占所有著作的10%，80%以上的著作都是神学著作，总字数超过140万，可见他研究宗教经典所用的时间，远远超过研究科学所用的时间。牛顿不仅在科学上的成就达到登峰造极的地步，而且对宗教经典的研究和认识，也令许多宗教学者大为惊奇。牛顿认为值得以生命作为资本投资在宗教经典研究上，他相信自己的劳苦不会付诸东流。看了牛顿有关研究宗教经典著作的人，都确信他的信念是完全正确的，牛顿随着科学成就的增多，名气的提高，对神的信仰也更加虔诚。牛顿所信仰的神，是圣经所启示和记载的高级生命。牛顿说：“我们应当把神的话---圣经，看为至高无上的哲学。根据研究的结果，圣经记载是有证，实在远非世俗的历史所能比拟。” 牛顿始终相信圣经中的预言，他说：“圣经预言有许多可信的凭据。”
牛顿对基督教经典圣经中的《但以理书》和《启示录》两卷的研究广博精深。他认真研究圣经中先知们的预言，为《但以理书》和《启示录》所用的深奥词语寻找普通的涵义。他讲到《但以理书》和《启示录》说：“如书的话是真实的，那么必须要发明一种新的旅行方式。人类的知识要加增，在某一日之前，人类可以每小时旅游50英里。”弗洛特尔知道了，他正如历代不信神的怀疑者一般，说：“看哪，那发明地心引力的聪明牛顿，当他到了老态龙钟时，就看起一本叫圣经的书来。我们如要相信这本书的胡说，我们就必须相信人类的知识要如此发达，以致我们每小时要旅行50英里，那可伶的老人。”这个不信者的自满态度，使他的朋友们随着他大笑，但是今天如有人走进汽车，他必须承认说：“牛顿是一个聪明的哲学家，而弗洛特尔是一个可伶的老人。”
牛顿确信圣经中有密码，他认为比万有引力更重要。因此他勤学希伯来文，努力求索圣经密码，花了一半人生，写了上百万字手稿。到临终时还在孜孜求索，由于当时没有电脑，不管他用什么数学模式，终归于徒然。但现在到了电脑时代，圣经密码已被逐渐破解，震惊了全世界，使众多不信仰宗教的人特别是年轻人归向宗教，也已使不少犹太人幡然悔悟。圣经密码的破解，使牛顿的推想得以实现。
有人认为牛顿研究科学遇到无法解决的问题才转向神，才转向宗教。也有人以为牛顿后半生如不研究神学，则会在科学上取得更大的成绩，而为牛顿大为惋惜。事实上没有任何科学家像牛顿取得那么大的成就，也没有任何科学家在圣经研究方面花这么大的功夫。说实在，世界上没有一个科学家够资格指责牛顿！
对于那些盲目反对宇宙中有高级生命存在的人，我举一个牛顿的例子。 在哈雷博士还未走入宗教前的一天，他对牛顿讲了一番不信神的话，牛顿不留情面加以斥责，正告他说：“哈雷博士，我对你关于天文数理的高见，一向乐于接受，因为你是研究有素的，但你对宗教，最好不要随便发言，因为我知道你对此毫无研究，并且我敢断然地说，你根本是个门外汉。”牛顿这样斥责他，是有重要理由的，因为他正是一个盲目反对者。后来哈雷博士经过彻底而严谨地研究，也走入了宗教。我们对于其他问题，照理必应先彻底研究，然后才能反对。牛顿的驳斥和见证，实在为一般盲目反对者的当头棒喝。