●吴邦国专机到沪宣布徐匡迪新任命
12月动向杂志报导，十二月三日下午，吴邦国乘专机到沪，在市委常委扩大会议上，代表中共中央宣布：中央任命徐匡迪为中国工程学院副院长兼党组书记，并对徐匡迪担任上海市长长达六年，给予了高度评价，称徐为「深得一干五百多万上海市民民心的市长」。徐匡迪在会上强忍著眼中的泪水，说：难以想像，自己担任了六年市长了从个人情感，要离开上海，是依依难舍的。对上海市民的爱护，对一起工作的同志的帮助，是深深感谢的。
●上海各界婉惜徐匡迪辞职
十二月三日当晚，上海市委市政府值班室就接到了上百起查询，慰问徐匡迪的电话传真。十二月七日，上海市第十一届人大常委会第三十四次会议正式通过关于接受徐匡沪……云上海市市长的职务，这个消息也正式公布、证实从三日到七口，已有七、八十个向徐匡迪致敬、慰问的花篮、鲜果篮送到市委、市政府。到了十二月八日，已有近千多封慰问、致敬信函送到市委、市政府。有的慰问信、卡上写著「徐匡迪，请您留下!」「黄菊该下台!」「黄菊无能又缺德!」「黄菊再留任，国家没前途!」……等等。
●沪人大表决徐辞职及陈良宇代市长情况
根据中共官场的游戏规则，十二月三日吴邦国先在党内上海市委常委会议上代表中共中央宣布对徐匡迪的新任命之后，还要在上海市人大常委会上走一下形式。
十二月七日，上海市第十一届人大常委会第三十四次会议，以「一会二制」表决了两个议案决定。
一、以举手表决通过《上海市人民代表大会常务委员会关于接受徐匡迪辞去上海市市长职务请求的决定》，表决结果：共五十二人出席，七人举手反对，十四人弃权；
二、以投票表决通过《上海市人民代表大会常务委员会主任会议关于提请审议决定上海市代理市长（陈良宇）》的议案，表决结果：十一票反对、十二票弃权。
●徐匡迪低调离任
徐匡迪为了避开「风头过劲」或其他原因，从十二月六日起就搬离住宅，住进了宾馆，婉谢了上百起学术界、科研界、文教界、工商界、民主党派团体，知名人士、外国驻沪商团为他设宴送行。徐匡迪也婉拒了黄菊以上海市委名义为他饯行，说：免了吧!日后人事变动还多著哩!
●市长和书记长期不和
徐匡迪和黄菊长期不和，在上海已是公开的秘密。徐、黄不时把二人争论的问题带到中央，也给江泽民、朱镕基和吴邦国带来了困扰。江、朱、吴多次批评：市委、市政府两个头不和，所造成的影响，下仅上海社会无人不知，连海外都在盛傅。
但，上海市民的民意、党内的民意，包括中央调查组多番调查的结果，徐匡迪的民意都远高于黄菊，这使黄菊很难堪，加上黄菊的生活作风问题一而再再而三出格，使得黄菊的名声很差。
●徐决意请辞并获准的原因
导致徐匡迪这次决意向中央请辞并获准，其原因是近期上海市委、市政府作年终总结，徐匡迪、黄菊二人在市委常委会议上又发生了激烈的争论，到了徐、黄二人必须有一人要离开的地步。这次省（区）、直辖市一级的年终工作总结，是从十一月中旬开始进行的，到十二月上旬要完成。
徐、黄展开激烈争论的主题有二。
其一，是关于上海沪东造船厂「七一七」重大伤亡事故。徐匡迪提出：市委、市政府要在总结报告中公开承担在安全工作上的失职责任。徐表示至于个人责任，我（徐匡迪）承担。如果下这样，对市民、对国家不作出负责的交代，今后将失信于民，不是负责任的政府。黄菊竭力反对，说：这样开了先例，以后凡事都要由市委、市政府承担，那党和政府还有威信和领导基础吗?如果社会要追究，追究到谁身上?徐匡迪说：我个人要承担。地基下陷，市政府是有责任的。
●关于新民晚报的问题
徐、黄发生激烈争论的另一个主题是关于上海新民晚报的问题。
近期以来，上海新民晚报的销量大幅下降。市民反映「晚报晚报，报喜报功报领导，这叫人民喉舌吗?」徐匡迪在市委常委会上说：新民晚报是有别于解放日报的。晚报在五十年代、六十年代初就很响，这就是晚报的特点。我看，社会反映是有道理的，对晚报不能设太多的条例。我对「主旋律」的理解，指的是办报的方向。报纸的主调、社会的阴暗面，包括党内败坏、阴暗的，经核实不涉及到机密，不影响法律，都可以披露。百姓对政府官僚、腐败的批评可以见报，否则，何来人民舆论监督!黄菊说：作为市委书记，不管、不抓宣传阵地，就是最大的失职。报纸不是商品，晚报不是娱乐、小道新闻的小报。对百姓的反映，要分析反映的是什么，不能销路下跌就改变晚报的方向。
有两次会议，都因为徐、黄争论太激烈而中止。
黄菊对新民晚报曾作过多次批评，要晚报注意方向…并提出了「五不准」：不准自发政治性新闻；不准随意转刊海外、外国有关中国政治、党政内部的评论和消息；不准随意转刊有损害国家对外路线、方针的海外、外国政治动态；不准转刊外地未经核实的消极、震荡性政治、社会新闻；不准刊登哗众取宠的低级趣味新闻。
黄菊的「五不准」下达后，立即引起新闻界的反感，曾向中宣部查询这是否中央对新闻界的新精神?黄菊在会上说：大上海将发展为国际经济、金融、科技、航运、贸易都市，但绝对不会变为乌烟瘴气文化、新闻充斥的城市：
●在京参加经济工作会议时递辞呈
十一月下旬，徐匡迪上京参加中央经济工作会议期间，见到江泽民、朱镕基，并提交了请辞报告，自九八年以来，这已是他第五次提交请辞报告了。徐提出：让他回冶金研究所搞本行工作，或准他返回母校（北京钢铁学院）执教。中央经济工作会议结束后，江泽民对徐匡迪说：回北京工作吧!
江泽民接受了徐匡迪辞去上海市长的职务。
●江泽民「舍徐保黄」面对黄菊上京难题
江泽民做出「舍徐保黄」的决定，是经过郑重考虑的。
严格说来，徐匡迪并不是江泽民「上海帮」的嫡系，因为江在上海任职时，徐匡迪还未走上仕途。徐匡迪是在一九九一年才从教职转为上海市计委主任，然后一步一步当上市长的。当时正是朱镕基、吴邦国主政上海时期。而黄菊一直以来都是江的亲信。因此，从个人情感而言，从个人和统治集团的既得利益着想，江需要「舍徐保黄」。
不过「舍徐保黄」，并不等于黄菊就不动了。
根据上海市领导层的政治生态，徐匡迪离去之后，黄菊在上海的威信低、声誉劣，也不可能再留任。江泽民如果把黄菊扯进新届中共核心层，等同毁了吴邦国、曾庆红，也毁了他自己。因之，黄菊上调中央书记处，根本不可能。可能被安插为人大副委员长，接替姜春云的职务。尽管这只是个「虚职」，但可以作为江、曾派系人马在全国人大常委核心中制衡人大委员长李瑞环或李岚清。问题是，黄菊恐怕也很难过人大副委员长要经过等额选举这一关。等额选举虽然是有限民主，但是当年姜春云在八届人大当选为副总理时，得票仅百分之六十二点五，九八年九届人大选人大副委员长时，得票仅百分之六十七，他这二次等额选举的得票率，曾创下中共等额选举的最低记录。黄菊的命运可能比姜春云还惨，这也是江泽民感到十分棘手的问题。
●朱镕基推荐黄菊接任人
关于继任黄菊新届上海市委书记的人选，朱镕基推荐的是吴仪或曾培炎。朱说：上海市委领导班子不能只升到中央、只调外省升官，也要能下去，外面干部也能到上海担任主要领导，这样对上海、对中央工作都有利。